明末清初到康熙實施海禁前，福建居民相繼渡海遷徒來台。1640年間，北天宮信士因世代信奉 北極玄天上帝，深得護祐。因此，遷徒來台定居時，首要奉請 北極玄天上帝金身護佑來台徒居原稱帝公祠，1670年間，來台先民之日常商活以略為安定。第二代陳其紅、陳傳進、陳桃亨、陳龍維、陳志要、陳志晉級遷徒來台親族等眾多信是著手籌建 玄天上帝廟殿。

   本宫廟地為一「毛蟹佳地」，廟殿正前案山嶺半山腰有兩個出泉眼，泉水長年不斷，其多毛效活耀其間。居民將最近廟前的一個出泉處築堤成井，蓄積泉水，此出泉處上方地名為「井仔頭」之由來。甲午戰爭，清朝失利把台灣割讓日本，北天宮附近因有義民起而反抗日軍進駐，日軍聲言打進赤水莊火燒村莊，信徒唯恐北天宮 玄天上帝金身及廟殿遭日軍燒毀，速將 玄天上帝金身移駕姜仔園莊一帶草寮密藏， 玄天上帝金身始免於難。

    初建廟殿是用土角牆及木材結構，歷經200多年風吹雨打，廟殿嚴重受損，1946年居民信徒決議重建新廟殿。